Apenas novos heróis, monstros e chefes. Creio q a ideia das expansões foi apenas trazer mais variabilidade na partida, mas ainda sim elas são meio repetitivas. 

Obrigado, mas a caixa base tem quantas missões???

Eu tenho e joguei o Masmorra e ele não possui missões, apenas modos diferentes de jogo:

Normal (PVP, mas pode ser jogado coop)
Épico (Coop PVE ou PVP)
Aliança (Coop PVE)

Os modos Épicos e Aliança possuem um boss final, que deve ser derrotado no tempo limite da Masmorra.
O modo normal não tem esse boss, a partida acaba quando o primeiro jogador chegar a um certo nivel (não lembro), aí se faz a soma de pontos e etc. pra declarar o vencedor.

Caso conheça o Masmorra de Dados, esse jogo é como se fosse um "2.0" dele baseado nos personagens do Arcadia Quest, os herois do Masmorra podem ser usados no AQ (as cartas já vem com o Masmorra) e os herois do AQ (Base, Inferno, Pets e Beyond) podem ser usados no Masmorra, caso possua o crossover kit.