Ruim que em King of Tokyo acho que não vamos encontrar respostas oficiais... Tem um FAQ pequeno da Iello, mas só sobre o jogo base...
Sobre sua dúvida, eu cancelaria todo o dano. Pra mim, o Meka Dragon deu um ataque, que causaria 3 de dano, ele usou um poder que aumentou o dano deste ataque em 2 (+2 danos extras, diferente de uma carta que diga "Causa 2 de dano", que seriam 2 de dano separado do ataque). Jack levou um único ataque de 5 de dano, se ele der a carta ao Meka Dragon, o ataque do Meka Dragon não causará dano. Esse é meu entendimento.
Abraços, fahr