Bacana demais o tópico.
Da minha parte, acho que o insert com papel paraná fica mais resistente do que o feito com o pluma.
além disso, pela espessura vc acaba ganhando mais espaço com a primeira opção também. O problema é que, por ser mais duro, fica mais difícil de cortar tb, mas nada que um bom estilete não faça.
Eu uso para o papelão paraná a cola branca da cascorez, é muito forte e fácil o manuseio.
O preço do paraná é bem ("bem muito") menor do que o do papel pluma, isso para mim é um grande diferencial.
Por último, eu não pintaria o insert (pelo menos no interior), sou meio paranóico, mas tenho o receio que com o tempo (ou uma tinta ruim), alguma peça acabe manchando.
Com relação às outras "alternativas" (saquinhos e caixinhas organizadoras), para mim são as melhores dicas. Aqui em Brasília, tem a Leroy Merlin que vende, e tem tb aquelas lojinhas que antigamente a gente chamava de 1,99.