gigante::No setup do cenário Segunda Gênese para 4 jogadores, só identificamos 2 setores para Casas Caídas, enquanto o Setup lista 4 casas.
As 4 entram em jogo mesmo ? Como dispor as Casas Caídas nos setores ?

São só duas casas caídas amigo.
Os 4 que listam ali no setup é pra você sortear ou, caso alguém escolha uma facção que conflita com a tecnologia básica da casa caía você tenha outras opções.
Quanto a disposição, é só embaralhar as 4, e colocar aleatoriamente uma casa caída aberta em cima do tile indicado no compêndio.

Particularmente eu uso o aplicativo que disponibilizaram por aqui mesmo, não o que é oficial.

Sempre que tiver mais casas caídas no setup do que em mapa você precisa sortear elas. 
Pega as cartas das casas e sorteia 2 dos 4 cards nesse caso.

As tecnologias nunca vão conflitar com as casas dos jogadores porque todas as 8 tecnologias do jogo correspondem as 8 tecnologias das casas caídas (2 tech p/ 4 casas).