Eu creio que você está certo nos dois pontos.

Nos deckbuildings que eu conheço, o custo de compra é pago só naquele momento de aquisição das cartas. Quando você joga elas da mão, o efeito é natural da carta comprada, sem custo, a não ser que o efeito dela diga o contrário.

Já no caso de poder tirar vários níveis de uma só vez se tiver dano suficiente, sim, você pode. A galera do Jogando Offline fez isso no vídeo deles e acredito que seja fundamental fazer combos pra conseguir tirar vários níveis de uma só vez, senão ficaria muito travado.

Fala Bruno, 

valeu pelo retorno. Na dúvida, realmente eu joguei pela lógica dos "deckbuildings".

Funcionou! rs

Só pra tentar ajudar na interpretação já que o manual é bem claro sobre essas dúvidas. 

O valor de cima é o recrutamento que vc paga somente 1 vez. Recrutamento é o ato de pegar a carta na "área de construção e recrutamento" e colocá-la na sua pilha de descarte (unidade) ou a sua frente (construção). O valor centralizado, abaixo das ilustrações, deve-se pagar sempre que quiser ativar a habilidade e não a carta.
Olhe a pg.15 no manual para melhores detalhes.

Na própria carta de resumo de turno (e no manual) diz que na fase de combate podemos usar os danos obtidos contra as unidades invasoras como quiser, ou seja, gaste eles matando um invasor, tirando 1 ou mais Níveis de algum invasor, atacando 1 ou mais invasores...

Espero que tenha ajudado