Bom dia rzirbes,
Vou tentar responder aqui (usei os textos do manual em PT-BR aqui da Ludopedia pra tentar ficar mais fácil):
1-) O nível da cidade significa o número de guardas dela? E se utiliza as fichas de monstro com o desenho de uma cidade, isso?
O nível significa quantas criaturas serão adicionadas. As fichas de monstros a serem usadas são das cores que têm na cidade.
"Se uma peça com uma Cidade no seu centro é revelada:
Pegue a carta da Cidade correspondente e coloque-a próximo ao mapa.
• Consulte a descrição do Cenário para ver de qual nível da Cidade. Pegue a miniatura da Cidade correspondente e rode a sua base de modo que mostre na janela o nível da Cidade. Coloque a miniatura sobre o espaço da cidade.
• A base mostra círculos de cores diferentes. Para cada círculo, compre uma ficha de inimigo da cor correspondente e coloque-o de bruços sobre a carta da Cidade." Não esqueça dos bônus que cada cidade oferece às criaturas!
2-) Somando o dano, posso somar dano de ataque normal, com dano de gelo/fogo, ataque a distancia para matar uma criatura? Todos estes danos seriam dados após a criatura me atacar, e a mesma sem qualquer proteção ou fortificação.
Sim. Pode usar qualquer dano na fase de ataque.
"Combate começa pelo compra e/ou revelação de todos os inimigos que você tem que lutar. Então, o combate tem quatro fases:
a. Fase de Ataque à Distância e de Cerco - Ataque à Distância (Ranged) e Ataque de Cerco (Siege) podem ser usados primeiro para tentar eliminar alguns inimigos antes que eles o ataquem.
b. Fase de Bloqueio - Inimigos não eliminados por Ataque à Distância e de Cerco fazem o seu ataque. Os jogadores podem usar efeitos de Bloqueio para tentar bloquear estes ataques.
c. Fase de Atribuir Danos – Qualquer inimigo não bloqueado faz dano. Pontos de dano devem ser atribuídos ao seu Herói e/ou as suas Unidades.
d. Fase de Ataque - ataque os inimigos usando quaisquer outros ataques restantes em sua mão (inclusive Ataques à Distância e de Cerco que você não tenha usado durante a primeira fase) para tentar eliminar os inimigos."
Lembre-se das resistências (just in case):
"Resistência Fogo - Todos os Ataques de Fogo são Ineficientes (metade). Inimigos ignoram qualquer efeito de não-ataque de cartas vermelhas ou habilidades forte das Unidades ativadas por Mana Vermelha.
Resistência Gelo - Todos os Ataques de Gelo são Ineficientes (metade). Inimigos ignoram qualquer efeito de não-ataque de cartas Azul ou habilidades forte das Unidades ativadas por Mana Azul.
Resistência Fogo e Gelo - Todos os Ataques de Fogo-Gelo são Ineficientes (metade)."
3-) Criaturas fortificadas só podem ser atacadas com cerco? Ou o cerco é utilizado apenas para começar atacando uma criatura fortificada? Exemplo, criatura é fortificada, não tenho cerco, tomo o ataque primeiro, depois ataco ela com um ataque normal.
Criaturas fortificadas só podem ser atacadas à distância usando cerco. Depois de receber o ataque (após fase de bloqueio) você pode usar qualquer ataque, como respondido na pergunta 2 (lembrando das resistências).
Na Fase de Ataque à Distância e de Cerco:
"Jogue qualquer número de Ataques à Distância e Ataques de Cerco de qualquer elemento - Fogo, Gelo, Fogo-Gelo, ou Físico (Ataques Físicos não possuem atributo elemental).
a. Você pode jogar cartas que fornecem Ataques à Distância ou Ataques de Cerco da sua mão (e fortalecer com qualquer Mana disponível), usar Habilidades de Ataque a Distância ou Cerco, ou ativar quaisquer Unidades com habilidades de Ataque à Distância ou de Cerco. Combine estes efeitos juntos em uma coluna para ajudar a manter o controle do valor total.
Se alguns dos inimigos escolhidos são Fortificados (ou porque estão defendendo um Local Fortificado, ou porque têm a Habilidade Fortifi cada em sua ficha), apenas Ataques de Cerco podem ser jogados. Você pode jogar Ataques à Distância somente se nenhum dos inimigos alvo escolhidos são fortificados.
• Se nenhum inimigo escolhido é fortificado, você pode jogar e combinar livremente Ataque à Distância e Ataques de Cerco.
• Inimigos que são fortificados duas vezes (porque eles têm a capacidade fortificada e eles estão defendendo um local fortificado) não podem ser escolhidos como alvo nesta fase, nem mesmo por Ataques de Cerco."
4-) Dano de fogo e gelo podem ser adicionado a um ataque a distância ou não, para atacar primeiro uma criatura?
Não e sim! heheheheh. Esses ataques contendo elementais têm que ser à distância ou cerco para atacar primeiro - podendo ser de gelo ou fogo ou gelo/fogo (na fase de ataque à distância). Ataques elementais normais não entram nessa etapa.
Conforme a pergunta 3:
"a. Fase de Ataque à Distância e de Cerco - Ataque à Distância (Ranged) e Ataque de Cerco (Siege) podem ser usados primeiro para tentar eliminar alguns inimigos antes que eles o ataquem.
...
d. Fase de ataque: Jogue qualquer número de Ataques à Distância e Ataques de Cerco de qualquer elemento - Fogo, Gelo, Fogo-Gelo, ou Físico (Ataques Físicos não possuem atributo elemental)".
5-) O altar, nas ruinas, pode ser utilizado diversas vezes ou apenas uma?
Apenas uma (tirei do walkthrough da Ludopedia também):
"Você encontra um antigo altar de algum deus esquecido. Neste caso, a Ficha descreve três Mana de uma cor particular. Você pode ativar o altar, pagando três Manas daquela cor. Se fizer isso, ganhe 7 de Fama imediatamente, descarte a Ficha de Ruína marque o espaço com uma Ficha de Escudo para lembrar que foi você quem realizou esta aventura. Se você não puder ou não querer pagar as três Manas, nada acontece."
6-) Comprei magias com influencia, na torre do mago, mas algumas eram bem ruins, mesmo assim comprei para ver o que aparecia depois, posso simplesmente retirar magias do meu baralho?
A menos que alguma carta te mande explicitamente retirar tal carta você não pode simplesmente retirá-la do seu baralho.
Caso tenha cometido algum erro o pessoal ajuda também! 
Abraço