Sim, para ambas as perguntas. O Mercado de Artefato serve tanto para você colocar marcador de influência no território correspondente, independente das construções das estruturas, como em uma estrutura construída nesse território (desde que você ainda não possua marcador de influência na estrutura).

Sobre a segunda pergunta, na verdade o único jeito de você colocar um marcador de influência nessa estrutura é utilizando o mercado de artefatos do território em que a estrutura se encontra, para se livrar da penalidade.

Você também pode utilizar uma estrutura mesmo que você não possua marcador de influência nela para colocar um marcador de influência no território (mas nunca em estruturas).

Rapazes, com esse entendimento joguei minha primeira partida.

Foi bem interessante, pois um dos jogadores não ia atrás dos recursos para construção das estruturas, ele tinha mais facilidade em comprar cartas de artefatos, ou seja, ele nunca participava das construções, apenas esperava elas ficarem prontas, colocava um estrela sob elas e removia a penalidade, depois voltava ao Mercado de Artefatos para colocar estrelas na região.

Ficou bem claro para mim que vai do gosto do jogador participar ou não das construções, ou ir direto no mercado de artefatos, claro, analisando os prós e contras das penalidades das estruturas.