Bom dia. A diferença de complexidade entre ambos os jogos é enorme. Spirit Island é um jogo denso que demanda bastante do ponto de vista estratégico, com partidas de duração de média a longa.
Marvel United é um jogo simples e de curta duração. É divertido, mas penso que em poucas partidas se torna repetitivo.
Caso o interesse seja em função do tema, recomendo o Marvel Champions que, na minha opinião, é um jogo melhor.
De qualquer forma, recomendo assistir um gameplay de ambos os jogos para ter uma noção das regras e qual se encaixa melhor no seu perfil.

O que o amigo falou acima. MU é bem leve, rápido

SI é um dos melhores jogos cooperativos e solo, com uma rejogabilidade imensa, mas exige bem mais do jogador. 

Se vc quer algo mais complexo e desafiador, vai de spirit island.
Se seu grupo gosta de apenas jogos leves, e vc quer colocar umas miniaturas bonitas e so dar risadas, vai de marvel.
Tenho o spirit e ja joguei o marvels, que achei bem divertido. Sao jogos bem distintos em seu publico alvo. Vc precisa definir o que seria melhor pra vc e seu grupo de jogo. Nada mais chato do que pegar um jogo e nao ter com quem jogar.
Pode ser que vc goste de um jogo mas ai nao agradar o seu grupo (ou por ser mto complexo, ou por ser mto simples) e vc fica com um jogo catando poeira na estante.

Spirit Island tem MUUUUUUITOO mais conteúdo e desafio na caixa base do que Marvel United com meia duzia de expansões. Não são jogos que normalmente comparamos, mas respondendo a sua pergunta, e sem conhecer o seu perfil, Spirt Island é muito superior. MAS...é como o pessoal já disse ai, depende de vc, depende do seu grupo, dependo do que vc ta buscando, depende do seu bolso...são muitos dependes...A melhor coisa é ler o manual de ambos ou ver videos de regras, gameplay e etc...

Nunca joguei o spirit island, mas se tiver disposto a investir nas expansões, o marvel united é excelente, me amarro mt jogar ele, mas se tiver pensando só no jogo base, mesmo sem ter jogado o spirit island, imagino q tenha mt mais rejogabilidade q só o base do united.

Tenho os dois na coleção !

Como dito em alguns comentários, Spirit Island é bem mais complexo em regras e estratégias, é um jogo denso e de cara já digo que o melhor coop que já joguei !!! Diversos combos, possibilidades e olhe que eu ainda nem joguei os cenários que vem com o jogo base !! Já o Marvel United é bem mais simples em regras, mas não é um jogo bobo ! Cada vilão trás uma forma diferente de interagir com o jogo, tendo assim que os jogadores se adaptarem a trama de cada vilão, realmente a caixa base do marvel united é o básico do básico que o universo united pode oferecer, recomendo a caixa base do xmen, ali tem muito conteúdo para uma caixa base !!, possibilitando jogar com 5 jogadores, com um deles controlando o vilão !! Cabe muito bem os dois na coleção, para aqueles dias que querem um jogo mais complexo e denso, vai de spirit island e naquele dia que você quer algo mais rápido, porém que apresente ainda uma dificuldade boa durante a gameplay, vai de marvel united !

Por aqui estamos jogando entre 1-2 partidas de marvel united antes ou depois de algo médio/pesado, é diversão garantida !!! 

Spirit Island ou qualquer outra coisa? Spirit Island
Mais de 300 jogos jogados e, disparado, Spirit Island é meu top 1 na categoria coop e solo
Ele não é dificil de aprender as regras, tá é longe de ser
Dificil é dominar os espiritos e jogar bem com eles

Já tive Spirit Island e vendi depois de umas 12 partidas. Acho a manutenção do jogo muito chata, toda hora esquecia alguma regrinha de ativação de carta (alcance, requisitos), o que deixava com aquela sensação ruim de ter jogado errado. Além disso eu achava o fim de partida muito anticlimático. 
Ou seja, é difícil dizer o que é bom ou ruim, gosto é muito pessoal. Reconheço que é um jogão, mas não é para mim. 
Se quer um solo capetoso eu indicaria Mage Knight, mas é outro que não é para qualquer um. 

Spirit Island, sem sombra de dúvida. 

Faço minhas as palavras do VitorMX. É minha primeira escolha pra uma partida solo, adoro jogar com minha esposa, e ela também pensa a msm coisa sobre o jogo.

Pessoal comentou sobre conteúdo na caixa base e tal, n posso falar sobre o Marvel, mas o Spirit tem MUITA coisa na caixa base, as expansões estão(FINALMENTE) chegando, mas eles n são nem de longe obrigatórias apesar de adicionarem quantidades absurdas de conteúdo. Se vc por acaso quiser mais conteúdo pro jogo e n quiser gastar mt basta pegar a menor "expansão" do Spirit; Chamas e Plumas, adiciona essencialmente 4 espíritos e 1 adversário  mas isso já amplia demaaaais o jogo.