Olá,
tenho de fato apenas uma resposta definitiva para suas dúvidas, mas depois de jogar centenas de jogos no BGA, talvez eu consiga te ajudar:
1. Até onde sei, não. Mas de fato, não vejo nenhuma vantagem em um jogador querer fazer isso. Em todos as minhas partidas, isso nunca nem me passou pela cabeça por dois motivos. Primeiro, porque as energias negativas descarregadas valem um ponto cada no fim do jogo. Segundo, porque você pode transformar ela em outra cor e agilizar sua partida (perdendo o ponto que ela daria no final). Como energias negativas descarregadas não são obstáculos nenhum para outras pedras, seria um movimento ilógico voltar elas para seu tabuleiro.
2. Não. Essa resposta foi dada pelo designer do jogo no BGG.
3. Até onde sei, não. Mas novamente, não há razão para querer fazer isso. Você já está ganhando os pontos e os chakras harmonizados não são um obstáculo. Você pode passar as outras pedras por cima. Logo, seria perda de tempo.
Espero ter ajudado.
Abraços.