Então, tirando os jogos que são apenas cartas, eu conto nos dedos de uma mão os jogos da minha coleção em que a caixa é do tamanho certo para a quantidade de componentes. De cabeça, apenas Caverna me vem a mente agora.
Tem isso que o Igor falou, uma valorização do produto para que ele atinja um preço especifico para atender determinada demanda. Existe também, uma questão de padronização da caixa, mas o principal mesmo é o marketing, jogos maiores chamam mais atenção e ajudam a vender mais, porém eles ocupam mais espaço na prateleira e no estoque das lojas, o que faz a o produto ter um valor maior e aumenta o custo de estocagem.
No jogo base até que não me incomoda, o pior é quando é a expansão. Existe alguns casos em que a expansão ocupada nem 20% da caixa.