Realmente ele necessita de um FAQ.

Ao meu entender ou se usa o efeito de "descarte" ou se escava uma ilha e sim, você pode usar mais de uma carta para escavar as ilhas com várias combinações, juntando quantas necessárias forem para poder escavá-las.

Não... O manual não é bom nem de longe!!!!
Vou tentar explicar como eu jogo:

1- vc descarta a carta sempre, ou pra fazer seu efeito ou para escavar! Mas sempre um ou outro.
1.2- quando puder e estiver escavando vc poderá utilizar o efeito da carta "mau presságio", neste caso descarte as cartas para realizar a escavação desejada e em seguida jogue/descarte a carta "mau presságio" para realizar seu efeito;
2 - sempre tenho essa dúvida também, e acabo combinando as cartas! Bem mais divertido.
3 - pedra + terra ou pedra + areia;

Bom é assim que costumo jogar. Não sei se é o certo mas faz sentido pra mim.

Aproveitando o tópico para não criar outro, me ajudem com uma dúvida da carta "mau presságio" ela me permite escavar 2 cartas e ficar com uma para mim, se uma das cartas for tesouro o tesouro fica comigo? Ou vai pros tesouros abertos? 

No caso do mau presságio escavar tesouro, entendo que vale a regra: uma carta de tesouro vai pra mesa e ficará com ele o primeiro que possuir a combinação de mapas para adquiri-lo.