Isso mesmo, a vitória por moedas leva em conta esse contador.
Você o avança toda vez que ganhar uma moeda, seja um token, seja de uma carta de great person, seja de um território controlado com uma moeda impressa etc, ou seja, não importa se a moeda é real ou virtual, o marcador é basicamente a contagem das moedas que você tem sob seu controle.
Então, quando você investe um token de moeda em uma tecnologia, você na verdade recua seu marcador, pois está "perdendo" aquela moeda para fins de uma vitória econômica. Está investindo, como diz o nome, e portando destinando-a a outro fim! É até bastante lógico.