1- Quando você resolve uma ordem de marcha, você determina quais unidade daquela área estão indo para um novo território. Quando esse novo território possui peças de outro jogador, ocorre o combate, ou seja, aqueles peças que foram movidas que fazem parte do combate e as peças que perdem o combate tem que sair. Então na situação que vc perguntou, as 3 unidades tem que ficar no território conquistado sim.

2- O porto não é uma área marítima, mas sim uma extensão da área de terra a qual ele está conectado. Seus navios só podem entrar em portos que pertencem a você, então no seu exemplo, não poderia recuar para o porto, pois o território, e consequentemente o porto, não são seus. E portos somente passam a ser seus, quando você conquista o território ao qual ele pertence. Nunca se pode conquistar o território pelo porto.

Agradeço a atenção e os esclarecimentos!

Lendo essa duvida me surgiu uma também:

Caso eu tenha dominio de uma área com um porto conectado, e tenha um soldado na terra, e um navio no porto, o que acontece se eu retirar meu soldado da terra sem deixar um token na area?

Tbm já aconteceu isso por aqui, pensamos e fizemos o seguinte acordo, interpretando as regras do jogo:

1) O porto pertence ao território, então se o território não te pertence mais, logo o porto tbm não. 
2) Você não pode marchar um navio para um porto que não pertence a um território seu, então pq vc poderia ficar num porto que não é seu?
3) Finalizando, esvaziou uma área com navio(s) no porto sem deixar um power token, perde o(s) navio(s) logo após deixar a área, pois ele poderia ter tirado(movido) o(s) navio(s) antes com uma outra marcha. 

Só para melhorar o entendimento, o porto surgiu na segunda edição. Antes se você perdesse a área de mar adjacente, você só conseguiria retomar se tivesse um barco em outra área. O que era um grande problema para os starks, pois os Greyjoy corriam para o mar e os starks tinham que se virar para defender uma extensão grande de território.