Na missão 3, o chefe da casa da moeda do palácio chama Petyr, mesmo cargo e nome do Mindinho na série Game of Thrones.

Na introdução do Storybook Immortal Souls:
"And it is I, the chronicler who alone can tell thee of his saga. Let me tell you of the days of high adventure!"
Retirado da introdução do filme "Conan, o bárbaro" de 1982, excelente trilha sonora por sinal.

Acho que todos os nomes das quests são referências de alguma coisa, essas são algumas que tenho certeza:

Storybook Arcane Portal
Wishmaster - Música do Nightwish no álbum de mesmo nome.
Hellraiser - música do Ozzy Osbourne, inspirada em um filme de terror de mesmo nome.
Fear of the dark - música do Iron Maiden.

Storybook Vastaryous' Lair
Be quick or be dead - música do Iron Maiden
The root of all evil - música do Dream Theather

Storybook Darkness Falls
Moochild - música do Iron Maiden, esses caras realmente gostam de heavy metal, principalmente dos "irons".
Cemetery gates - música do Pantera.
Temple of doom - apesar da temática não ser medieval, acredito que seja inspirada no primeiro filme do Indiana Jones.

Agora, essa do Esqueleto é totalmente verdade 

Esqueceram do Jack crow, desculpa capitão jack Crow