Oi, Ivanney.
Depende do seu gosto. As diferenças de regras entre Zombicide moderno e Black Plague não são tão grandes assim. Você pode, inclusive, implementar algumas regras do BP no moderno como "regras caseiras" sem problemas.
O que pesa mesmo é se você prefere um cenário de apocalipse zumbi atual ou com tema de fantasia. Se for o segundo caso, vá de Black Plague.
Eu, particularmente, acho que o tema apocalipse zumbi combina mais com a época atual, e acho que Zombicide aborda esse tema muito bem. Além disso, se for para jogar fantasia medieval há outros jogos muito melhores. Resumindo: eu prefiro o moderno, por questão de gosto e tema.
Agora, se você quiser tentar o moderno, minha dica é começar pela primeira caixa, e não pelo Rue Morgue. A Season 3 seria o Zombicide 2.0, com regras mais "avançadas" e certas complicações que achei dispensáveis, por questão pessoal (prefiro a simplicidade das primeiras caixas). Agora, se você já conhece Rue Morgue e gosta, vá em frente.
Então minha recomendação pessoal é começar pela Season 1 e eventualmente adicionar uma expansão, como Toxic City Mall.