Arrakis é um mundo desértico aparentemente morto e estéril, mas aqui está o recurso mais importante da galáxia: Spice. Sem Spice, as viagens espaciais são impossíveis e os humanos se tornam pequenos aglomerados em planetas isolados. A nobre Casa que controla Arrakis e a produção de Spice tem grande poder. O Imperador deu Arrakis à Casa Atreides, mas depois conspirou para substituí-los por seus antigos rivais, a Casa Harkonnen. O Barão Harkonnen esmagou os Atreides em um ataque traiçoeiro e agora governa o planeta com mão de ferro. Mas Paul e Jessica, herdeiros da Casa Atreides, estão vivos e estão montando uma rebelião com a ajuda dos formidáveis ​​Fremen, os misteriosos habitantes das extensões áridas de Arrakis.

Apenas uma Casa sairá vitoriosa da luta que se aproxima, enquanto a outra se perderá nas areias do deserto. É nessa realidade sombria que os jogadores serão empurrados em Dune: War for Arrakis.

Neste jogo de estratégia assimétrica, os jogadores lutam pelo controle do planeta, manobrando tropas como os Fremen, os Fedaykin e os temíveis Sardaukar, enquanto enviam colheitadeiras de especiarias para o deserto profundo, ousando desafiar os grandes Sandworms. O jogo apresenta um sistema de dados de ação com inúmeras cartas de eventos que permitirão aos jogadores recontar a saga Dune de maneira diferente a cada jogada.