Acabei de jogar, pelo que eu entendi do 1: se tiver o símbolo de dado, você é obrigado a mudar a face do dado, mas seguindo aquele ( +/-) do valor do dado. Se não tiver, você só altera o dado se no setor já tiver um dado com a mesma face, começando sempre com menor valor possível.
Quanto as sementes eu também fiquei na dúvida, mas lendo o texto do manual do solo (fig 2), me parece que se você não colocou sementes em uma área, a penalidade ocorre. Isso aplica quando está vazio ou só tiver sementes do autômato.