Nunca joguei o Junior, só o clássico, que gosto bastante. Tentei achar o manual dele, mas não consegui, então dei uma olhada em alguns vídeos do youtube pra ter uma noção das diferenças e te ajudar. Falo então com base no que youtubers-mirins me ensinaram haha
Me parece que o Junior é bem mais simples. Ele tem menos peças, a faixa é menor (o clássico vai de 1 a 13, o júnior de 1 a 10) e ele tem mais pedras-curinga (o dobro). Isso deve facilitar muito conseguir montar a sequência.
Ele também tem um esquema de pontos positivos, que você ganha ao baixar peças na mesa. No clássico ganha quem bate primeiro, e os perdedores acumulam pontos negativos de acordo com o que sobrou na mão. Assim, o Junior parece menos maldoso com quem ficar com peças na mão e incentiva os jogadores a baixarem muitas peças ao invés de correr pra bater.
Agora, a principal diferença diz respeito a manipulação da mesa. Ao menos nos vídeos que vi, no Junior você só pode baixar peças da mão para a mesa, sem mexer no que já está lá. No clássico, o brilho do jogo é você manipular todas as sequências da mesa pra conseguir baixar suas peças, quebrar um monte de sequências e fazer umas jogadas que você finalmente conseguiu enxergar depois de muita reflexão. Eu adoro essa sensação que o jogo passa.
Veredito final: não acho que o feeling dos jogos é o mesmo para justificar pegar o Junior só pelo preço (no sentido de você estar comprando o mesmo jogo, só que mais barato). Se você pretende jogar com crianças, aí tem que ver qual mais se adequa, mas posso dizer que joguei muito o clássico quando tinha uns 8 anos, então não acho que jogar com crianças seja um problema, ao menos dessa idade. Eu particularmente acho que a parte mais legal do jogo foi removida nessa versão aí, então num geral, eu recomendaria o clássico mesmo.