Também gostaria de saber opiniões de qual é melhor...

Tenho o Invader com a expansão e já vi jogarem o Dark Side.

Também fiquei na dúvida e o que eu ponderei foi o seguinte:
Invader pode ser adicionado a expansão Black Ops, ela se encaixa perfeitamente, todas as missões da expansão foram idealizadas unindo INVADER+BLACK OPS. (além de que na internet tem mais de 20 missões usando só a caixa do INVADER). 

Dark side existe apenas as missões da caixa base (só achei uma a mais na internet =/) e outras 10 que vem no KS Extra que une a caixa base INVADER+DARK SIDE (Ps. não é fácil achar o KS EXTRA do dark side e o preço dele é o de uma caixa base do jogo)
Ou seja para jogar com as missões extras você teria que ter o INVADER e o DARK SIDE, além do KS extra.

Ponto FORTE do darkside pra mim são os Xenos, além de serem de outra cor, tem uma resistencia maior que os normais em determinadas condições.

É válido lembrar que Zombicide é um SandBox, você pode criar suas próprias missões e deixar a rejogabilidade infinita do game (fazendo ajustes é possível inclusive unir seasons diferentes!!), o que independe de ser invader ou dark side, porem se você não curtir criar o próprio jogo ai é melhor seguir as missões já existentes e sugeriria a caixa do Invader pelos motivos já citados.

Eu acho mais fácil de achar e melhor o Darkside

No invader há sobreviventes comuns e soldados. Os comuns procuram em qualquer lugar mas não são tão preparados para combate. No Dark Side todos os sobreviventes são soldados incluindo um robô que, se não estiver morto, a cada rodada regenera a vida. Único lance que soldado só procura em alas de segurança (vermelhas) mas tem item inicial que te ajuda a procurar em outros compartimentos no Dark Side.

No invader É MUITO CHATO você ter que sempre pegar oxigênio para zonas fora de instalações. No Dark Side as zonas fora são escuras limitando campo de visão porém não tem a limitação de oxigênio.

Todo Zombicide tinha que ter dois itens para o super explosivo (garrafa + gasolina, bile de dragão + tocha...). Invader também precisa de dois itens enquanto no Dark Side é um item só e tapa as fissuras.

Venha para o Dark Side da força!