Baseado no seriado de mesmo nome, cada jogador encara um agente do FBI e um Arquivo-X. O objetivo do jogo é descobrir o Arquivo-X de seu adversário.

Cada Arquivo-X tem 4 traços com seis sub-traços dentro de cada característica. Durante o jogo você usa seus agentes para fazer as investigações. Se você fizer isso com sucesso, você pode fazer uma pergunta cuja resposta deve ser "sim" ou "não" para o seu adversário, por exemplo, "Seu Arquivo-X tem a característica ______?".

Quando for a sua vez, você pode usar os agentes extras, equipamentos, aliados, eventos e locais para investigar. Seu oponente pode usar adversários e eventos. Depois de cada um jogar as cartas, verifica-se o cartão do local e em seguida o dos agentes para ver se suas habilidades ajudaram na investigação. Se os requisitos dos agentes forem suficientes, o local é considerado investigado.

Há também um jogo avançado, com suas regras próprias.