Trouble on the Tempus é um jogo sobre viajar pelas profundezas do espaço em uma nave espacial encantadora... enquanto ela pega fogo, os componentes eletrônicos explodem e ela se desintegra ao seu redor. Você está praticamente condenado. Por sorte, você está em uma máquina do tempo, parte de uma missão exploratória para testar a mais recente tecnologia de viagem temporal, mas você levou a nave longe demais e as coisas deram terrivelmente errado.

Felizmente, como mencionado, a Tempus é uma máquina do tempo. Seus oficiais científicos a improvisaram para realizar saltos muito localizados da tripulação, permitindo que vocês se transportem de volta a um tempo em que não estavam prestes a explodir, na esperança de que, se conseguirem reunir informações suficientes sobre o futuro, possam evitar a destruição final.

Claro que não é um sistema perfeito. Se você causar muitos paradoxos, a nave pode acabar presa em um destino muito pior do que explodir nas profundezas do espaço, se tal coisa for possível.

Trouble on the Tempus é um jogo cooperativo de gerenciamento de desastres onde os jogadores devem evitar incêndios, falhas elétricas e mecânicas enquanto trabalham para consertar o hiperpropulsor do Tempus para poderem voltar para casa. Tragicamente, esta é uma tarefa verdadeiramente impossível, então os jogadores não terão escolha a não ser acionar a unidade temporal da nave, reiniciando o tabuleiro para a forma como estava no início do jogo, para que possam tentar novamente com o conhecimento adicional de quando e onde os desastres ocorrerão.

Se você conseguir repetir a linha do tempo o suficiente, coletando o equipamento certo e se posicionando para evitar os desastres conforme eles acontecem, você conseguirá prever rodadas suficientes para consertar o hiperpropulsor e vencer o jogo. No entanto, cada vez que você viaja no tempo, você causa um paradoxo, e a dificuldade do jogo pode ser ajustada pela quantidade de paradoxos que você consegue causar antes que a realidade desmorone sobre si mesma.