Theseus: The Dark Orbit coloca os jogadores no centro de um conflito entre cinco facções presas na estação espacial de mesmo nome no espaço profundo. Apenas uma pode sobreviver...

- Comande as Forças Navais! Use armamento mortal, criando armadilhas e minas nos corredores para defender a raça humana.
- Comande a raça alienígena! Use passagens secretas e dutos de ventilação para lançar ataques de surpresa e agrupar pequenos aliens para assumir o controle da estação.
- Comande os cientistas! Use os computadores e dispositivos tecnológicos para coletar dados e informações de registro sobre outros habitantes da estação.
- Comande os Greys! Use seus poderes mentais para controlar o inimigo.
- A quinta facção? É um mistério. É precisamente por isso que você fez a viagem para Theseus, e é por isso que você vai morrer...

Em Theseus: The Dark Orbit, os jogadores movem seus peões em torno da estação espacial e ativam as habilidades de diferentes salas. Cada movimento que você faz altera as possibilidades de movimento do seu oponente. Em seu turno, você precisa pensar em qual sala você quer chegar e (além disso) como bagunçar o movimento do seu oponente, o que leva a grandes escolhas e decisões significativas.

As habilidades das salas mudam durante o jogo quando os jogadores instalam cartas de características que dão às salas novas habilidades e competências. Os jogadores criam Theseus durante o jogo, colocando armadilhas, armas inteligentes, passagens secretas e muitas outras características. Em cada jogo Theseus cresce diferente...

Regras para equipe permitem que os jogadores se envolvam em batalhas dois-contra-dois. Com facções equilibradas, os jogadores serão capazes de travar batalhas envolventes e mortais como um time. Cada facção tem um baralho único de cartas, e antes do jogo começar, você descarta dez cartas do baralho. No modo básico o descarte é de forma aleatória, mas no modo torneio (master) você escolhe cartas e constrói o seu baralho. Com cinco facções e 110 cartas, o jogo pode proporcionar partidas experiências únicas.