Neste jogo de estratégia, você guiará a expansão da fazenda da sua família para além dos limites conhecidos da floresta. À medida que seu assentamento cresce, mais pessoas se reunirão sob sua bandeira. Você cultivará a terra, construirá novas comunidades e moldará o futuro. No entanto, você deve proceder com cautela. Sua expansão pode perturbar os espíritos que ainda habitam a região selvagem. Os yokai são vigilantes e suas travessuras podem atrapalhar seus planos se você não reconhecer sua presença. Aumente sua influência, adapte suas estratégias e atraia as pessoas certas para o seu assentamento para ganhar pontos de vitória.

Em Shugendo , cada jogador possui seu próprio baralho de cartas. Durante o jogo, você aprimorará seu baralho substituindo suas cartas iniciais mais fracas por cartas de colonizador mais poderosas. Em cada rodada, os jogadores jogam três fases: revelação, ação e recrutamento. Na primeira fase, eles revelam cartas até decidirem parar ou até "explodirem", revelando 7 ou mais ícones yokai. Se isso acontecer, eles só poderão jogar a fase de ação ou a fase de recrutamento. Na fase de ação, os jogadores aumentam seus medidores com base nas cartas reveladas e realizam uma das ações principais (explorar, expandir ou desenvolver). Finalmente, na fase de recrutamento, os jogadores recebem vários bônus com base nas cartas reveladas e recrutam cartas das eras desbloqueadas.