Uma base permanente está sendo construída na cratera Shackleton, no Pólo Sul da Lua. Você está liderando uma das agências espaciais que estão trabalhando juntas para expandir sua presença na base, enquanto, ao mesmo tempo, as três grandes corporações que patrocinam a missão estão cada uma perseguindo sua própria agenda. Em Shackleton Base: A Journey to the Moon, você construirá estruturas na base, ao mesmo tempo que financiará projetos de corporações que fornecem habilidades especiais e oportunidades de pontuação.

No início do jogo, escolha três empresas aleatoriamente entre as sete disponíveis. Cada corporação apresenta novos projetos, ações e oportunidades de pontuação, juntamente com seus mecanismos específicos. O jogo é disputado em três rodadas, cada uma dividida em três fases:

• Fase do ônibus espacial: Cada jogador escolhe uma peça do ônibus espacial em uma exibição aberta para determinar que tipo de astronautas e recursos ele pode usar naquela rodada, bem como a ordem dos turnos para a próxima fase.

• Fase de ação: os jogadores se revezam na implantação de seus astronautas na Lua para coletar recursos, construir estruturas ou financiar projetos. Dependendo das empresas selecionadas, estarão disponíveis diferentes tipos de recursos, recursos que podem ser utilizados de diversas formas para os projetos ou para a construção de estruturas. Cada projeto fornece habilidades contínuas e oportunidades de pontuação. Cada corporação oferece diferentes maneiras de marcar pontos, que podem ser durante a fase de ação, a fase de manutenção ou no final do jogo.

• Fase de manutenção: Os astronautas destacados são designados para trabalhar nas estruturas (fornecendo um bónus ao jogador que as possui), depois os jogadores recolhem rendimentos e pagam os custos de manutenção. Se as corporações em jogo tiverem efeitos finais, esses efeitos ocorrerão.

O final do jogo traz uma pontuação final, então o jogador com mais pontos vence.