Na década de 1950, o Afeganistão passou por várias décadas de modernização e relativa paz. As reformas do rei Mohammed Zahir Shah incluíram uma constituição, sufrágio universal, direitos das mulheres e um parlamento. No entanto, o partidarismo interno e a competição da Guerra Fria acabariam por destruir a paz que ele construiu. Um golpe em 1973 pelo primo do rei, Mohammad Daoud Khan, gerou conflito com os comunistas do país que, por sua vez, derrubaram e mataram Khan em 1978. A Revolução Saur comunista levou a muitas repressões contra inimigos políticos, incluindo líderes tribais, religiosos e intelectuais , e outros comunistas. Em meados de 1979, muitas partes do país estavam em revolta aberta. A instabilidade crescente do Afeganistão preocupava o governo soviético. A União Soviética invadiu o país em dezembro de 1979. Na ponta de lança desta invasão, forças de propósito especial do Comitê de Segurança do Estado (KGB), a Diretoria Principal de Inteligência (GRU) e as Forças Aerotransportadas Soviéticas (VDV), apreenderam edifícios importantes na capital afegã e mataram e capturaram altos funcionários do governo afegão. Operação A tempestade -333 marcou a descida do Afeganistão a um capítulo novo e sombrio.

O jogo é jogado em duas fases: a fase de planejamento e a fase de execução. Durante a fase de planejamento, o jogador gerencia o apoio dos ministérios do poder soviético (KGB, GRU, Estado-Maior e Politburo), designa líderes-chave e unidades militares para alvos específicos e conduz operações de inteligência, treinamento e especial missões para moldar a operação. O jogador também deve gerenciar eventos aleatórios que podem afetar negativamente a operação, bem como se proteger contra o alarme do próprio governo afegão sobre uma possível invasão. Durante a fase de execução, o jogador completa cada missão tática na ordem de escolha do jogador em mapas ponto a ponto.

Operation Storm-333 coloca o jogador no centro de uma operação de propósito especial que é tida em alta conta pelas histórias soviéticas e russas, mas também desencadeou as muitas décadas de desespero vividas pelo povo do Afeganistão. Embora a missão tenha sido um sucesso tático geral, a campanha que serviu acabaria por levar à dissolução da União Soviética, à ascensão do Talibã e aos ataques de 11 de setembro de 2001. Poucos eventos na história se posicionam tão claramente em um nexo de muitos futuros possíveis.