Ninja Taisen é um jogo abstrato dirigido por dados, com setup aleatório. Ambos os jogadores têm conjuntos idênticos de dez lutadores, com três lutadores em cada uma das três cores com valores 1-3, juntamente com uma carta do shogun com todas as 3 e com valor de 4; esses lutadores são colocados em pequenas pilhas de tamanho variável em uma linha que é de onze passos de comprimento. No turno de um jogador, ele rola os três dados coloridos e pode fazer até três movimentos de acordo, com o dado azul movendo um lutador azul, etc. Movendo um lutador que tem outros lutadores em cima dele move esses outros lutadores também.

Vence o primeiro jogador a derrotar todos os lutadores adversários ou chegar ao final da linha (e limpar os lutadores do adversário em sua aldeia).