Nexus Ops é um jogo de guerra de ficção científica de complexidade leve a média. O jogo apresenta um tabuleiro hexagonal que é montado de forma diferente a cada partida e, na edição da Avalon Hill, inclui miniaturas que brilham no escuro e muita ação de combate. Os jogadores controlam corporações futuristas rivais que lutam entre si pelo controle do Rubium, o minério da lua. Ao vencer batalhas e cumprir Missões Secretas, é possível obter pontos de vitória.

As unidades são compostas por várias raças alienígenas e possuem estatísticas semelhantes às usadas na série Axis & Allies. O combate também segue um estilo parecido. Jogadores que perdem batalhas são recompensados com cartas de Energização, que concedem poderes especiais posteriormente. Também é possível obter essas cartas controlando o Monólito, uma estrutura elevada no centro do tabuleiro. O primeiro jogador a alcançar o número necessário de pontos de vitória vence o jogo.