O muro de Jerusalém foi destruído. As pessoas estão cheias de grande vergonha e em apuros. Sem o muro, israelitas e o Templo não estão seguros. Nehemiah ouviu falar sobre a situação na cidade, viajou de Babilônia, e conduziu os trabalhos de reconstrução.

Em Nehemiah os jogadores assumem o papel de líderes israelenses que ajudam a reconstruir o muro de Jerusalém. O jogo é baseado em um mecanismo de alocação de trabalhadores.