Ao longo dos séculos, cientistas loucos sempre encontraram o mesmo problema de acesso muito limitado aos recursos perigosos que necessitam. Para resolver este problema, o Mad Science Foundation foi criado. Agora, esses "gênios incompreendidos" podem finalmente obter o acesso necessário aos quatro blocos de construção vitais da ciência louca: Lasers, Dark Matter, Cryptomium e Sharks.

Infelizmente, para cada cientista louco que procura "financiamento" da Mad Science Foundation, permanece o fato infeliz da vida que os cientistas loucos não se dão bem com os outros. Na busca pela infâmia, os diretores serão subornados, os recursos serão realocados, espiões serão enviados, invenções serão sabotadas, e grandes botões sinistros serão pressionados com resultados catastróficos. Bem-vindo ao Mad Science Foundation, onde todos estão prontos para apunhalá-lo pelas costas com máquinas excessivamente elaboradas.

No fundo, Mad Science Foundation é um jogo de seleção. Você seleciona recursos para selecionar invenções malucas e enviar asseclas para ajudar com os seus planos diabólicos. A cada rodada, um jogador controla o Director Crooked para aquela rodada. Eles, então, separam as mercadorias disponíveis em pilhas para serem selecionadas. Cabe ao cientista que controla o Diretor determinar o valor de quaisquer recursos disponíveis e separá-los em pilhas. Nem todas as pilhas são iguais! Os jogadores então se revezam escolhendo qual pilha de guloseimas quer agarrar, com o Diretor escolhendo por último. Avaliar seus competidores é a chave! Você sabe o que eles precisam; não deixe que eles tenham.