Field Commander - Robert E. Lee se baseia no design e na jogabilidade de Field Commander - Napoleon para colocar o jogador no comando do Exército da Virgínia do Norte durante a Guerra Civil Americana, com as forças da União controladas por uma IA.

Lute em 5 campanhas:

Seven Days Battles
Second Manassas
Antietam
Chancellorsville
Gettysburg

Field Commander - Robert E. Lee tem como base o design de Field Commander - Napoleon, com algumas diferenças e evoluções importantes.

Níveis de Dificuldade: O jogador pode personalizar sua experiência ajustando o Nível de Dificuldade entre Regular, Difícil e Veterano. Existem várias formas pelas quais o nível de dificuldade pode afetar o jogo, e o jogador pode escolher um ou mais efeitos, ou combinar diferentes Níveis de Dificuldade para criar efeitos variados. Por exemplo, o jogador pode escolher usar a tabela de Névoa da Guerra Regular, combinada com a opção de Pontos de Comando Difícil e as Regras Especiais de uma campanha no nível Veterano.

Marcadores de Batedores: Maior disponibilidade e uso de marcadores de Batedores para criar decisões mais estratégicas e simular o modo como a cavalaria era empregada no campo de batalha durante a Guerra Civil Americana em comparação com a era napoleônica.

Pontos de Comando: Os Pontos de Comando substituem os Pontos de Suprimento. São utilizados de maneira similar, mas representam a reorganização de Forças desestruturadas ou a convocação de Brigadas e Regimentos isolados que marcham por estradas diferentes. Pontos de Comando também podem ser acumulados quando uma Força atinge certas Regiões no Campo de Batalha e refletem moral elevada.

Ordens da União: Cada mapa de Campanha inclui uma Área de Batalha, distinta do restante do tabuleiro (delimitada em vermelho na arte dos mapas). As Forças da União seguem Ordens do Mapa de Campanha até entrarem na Área de Batalha, momento em que passam a seguir a tabela de Ordens da Área de Batalha. Isso simula com mais precisão as ações da União após o início real dos combates.

Táticas da União: Agressiva vs Defensiva. Nada de ficar parado no fundo do Campo de Batalha apenas disparando contra o inimigo em avanço. A IA da União só atacará quando as chances estiverem a seu favor.

Planos de Batalha Especiais: Uma gama expandida de Planos de Batalha Especiais para uso da IA da União que simulam o combate na Guerra Civil Americana. A IA da União agora só carregará em massa, enquanto Fogo de Flanco e Marcha Oculta ameaçam a retaguarda do exército confederado. Nenhum ponto do campo de batalha está seguro!

Captura de Artilharia: Em vez de destruir a artilharia, tanto o jogador confederado quanto a IA da União poderão capturar canhões "abandonados" e usá-los a seu favor. Historicamente, isso foi especialmente importante para os confederados, que sofriam diante da superioridade dos canhões e munições da União.

Atenuação de Alcance da Artilharia: Quanto mais distante o alvo, menos eficaz será a artilharia!

Cada campanha apresenta Regras Especiais detalhadas que destacam os eventos-chave, características e personalidades dos comandantes de cada batalha.