O misterioso assassino Kira conseguiu tirar outra vida. Desconcertado pela aparente habilidade de Kira em atacar qualquer um, em qualquer lugar, a Interpol convocou o lendário detetive "L". Agora o jogo de gato e rato começou: L deve fornecer alvos específicos para Kira de modo a deduzir sua localização e, finalmente, sua identidade. Enquanto isso, Kira continua a decretar sua sobrenatural marca de justiça homicida, correndo para completar sua lista e desaparecendo sem deixar rastros.

Death Note: Confrontation é um jogo de dois jogadores no qual um jogador assume o papel de L, tentando localizar e capturar Kira, e o outro joga como Kira, punindo aqueles que ele entende serem merecedores da pena capital. Cada jogador usa o caderno específico de seu personagem e, como L, revela criminosos como alvos e localiza sistematicamente Kira, ou, como Kira, elimina esses alvos para ganhar pontos de vitória suficientes.