Indigo é um jogo de colocação de peças nos moldes de Metro, Tsuro e Linie 1, no qual os jogadores constroem caminhos pouco a pouco, sem que nenhum jogador possua os caminhos individuais e todos tentem explorar os caminhos já presentes. Ao contrário dos jogos anteriores, porém, seu objetivo é mover as pedras preciosas de seus locais iniciais no tabuleiro para os objetivos designados, com o jogador que marcar mais pontos vencendo o jogo.

Para configurar o tabuleiro de jogo, coloque a peça hexagonal central e adicione cinco gemas verdes e uma gema índigo a ela. Coloque seis peças de "inversão de marcha" em seus locais designados na borda externa do tabuleiro de jogo e, em seguida, coloque uma gema amarela em cada uma dessas peças. Cada jogador coloca marcadores de gol nos gols entre essas peças de inversão de marcha na borda do tabuleiro de jogo: em um jogo para dois jogadores, os jogadores alternam objetivos; em um jogo de três jogadores, cada jogador tem um objetivo para si, enquanto compartilha outros dois; e em um jogo para quatro jogadores, cada jogador compartilha um objetivo com todos os outros jogadores.

Num turno, um jogador coloca uma peça em qualquer espaço do tabuleiro de jogo, com a única restrição de que o jogador não pode criar uma rota diretamente de um objetivo para outro. Cada bloco possui três segmentos de rota, conectando um par de arestas. Se um jogador colocar uma peça próxima a uma pedra preciosa, essa pedra preciosa "se move" o mais longe possível ao longo da rota para que todos os jogadores possam ver onde colocar as peças para mover a pedra preciosa em seguida. (Assim, os jogadores evitam a ginástica mental exigida em Metro e Linie 1, em que nada se move até que uma rota seja concluída.) Ao conectar-se à peça central, as gemas verdes se movem primeiro, com a gema índigo se movendo apenas na sexta conexão.

Se um jogador colocar uma peça de forma que uma gema colida com outra, ambas as gemas serão removidas do jogo!

Quando uma gema é movida para um objetivo de propriedade de apenas um jogador, esse jogador fica com a gema. Se dois jogadores forem os donos do gol, ambos os jogadores coletarão uma gema daquela cor, retirando da reserva a gema extra necessária. Assim que todas as gemas forem reivindicadas, o jogo termina, com os jogadores ganhando 3 pontos por uma gema índigo, 2 por uma verde e 1 por uma amarela. O jogador com mais pontos ganha.