Deixados para morrer, três jovens estudantes lutam por suas vidas contra uma entidade desconhecida. A criatura, se é isso, parece aprender e evoluir para combater todos os seus movimentos. Eles devem caçá-lo e destruí-lo, antes que ele os encontre primeiro.

Anomaly é um movimento oculto, dedução e jogo de combate para 2-4 jogadores. Os jogadores neste jogo são divididos em 2 equipes. Um jogador é a Anomalia, enquanto os outros jogadores são os Alunos. O objetivo de cada equipe é eliminar o outro, esgotando seu pool de saúde. Os alunos compartilham um pool de saúde coletivo. Todos os alunos e a Anomalia executam seu movimento atrás da tela de um jogador, então é raro saber exatamente onde outro jogador está. Os alunos tentarão sinalizar sua localização para os outros alunos usando cartões de dicas de localização, e a Anomalia, por sua vez, usará esses cartões para triangular as posições dos alunos.

A Anomalia precisa se alimentar para permanecer vivo, seja no combustível ou nos próprios alunos. Os estudantes trabalharão para destruir as fontes de combustível da Anomalia e danificá-la com armas improvisadas, como armadilhas e bastões de choque. Os alunos têm cartas com habilidades que os deixam e atacam ou realizam outras ações. No entanto, quando eles usam uma dessas ações, eles devem dar o cartão para a anomalia. As cartas têm habilidades inversas para a Anomalia que lhe dará novos poderes, como Possuir ou Teleportar. Se a Anomalia receber cartas suficientes, ela também poderá evoluir e desenvolver habilidades ainda mais poderosas. O jogo termina quando o pool de saúde da Anomalia ou dos alunos está esgotado.