Em Alien Entity: Mutated, você joga como um grupo de astronautas tentando escapar de uma nave médica sabotada. Um membro desconhecido da equipe foi mutado por uma entidade alienígena e irá sabotar e mutar os pesquisadores enquanto tentam reparar a matriz de satélites para contatar o controle da missão. Você vai sobreviver? Seus amigos serão mutados por uma entidade alienígena? Você pode entrar em contato com o controle da missão antes que seja tarde demais? Pegue alguns amigos e junte-se à paranoia!

Alien Entity é para ser jogado várias vezes. Os jogadores passam cartas viradas para baixo para determinar quem está jogando como um humano ou um alienígena. Os humanos ganham se a matriz de satélites for construída, eles escaparem na nave de escape ou o alienígena for atingido. O alienígena ganha se distribuir cartas de mutação para todos os humanos. Após o término de cada jogo, os jogadores podem ser elegíveis para abrir pacotes de expansão de estilo legacy, dependendo do resultado de cada jogo.