Lost Clans apresenta 5 novos clãs ao jogo, com um total de 12 novas cartas. Esses clãs adicionam combinações mais difíceis e permitem uma melhor experiência com 4+ jogadores. Os clãs são os seguintes:

Utsunomiya - 1 carta (4 pts) - 4 viradas
Saito - 2 cartas (3 pts cada) - 6 viradas
Otomo - 3 cartas (2 pts, 3 pts, 4 pts) - 11 viradas
Kuroda - 3 cartas (2 pts, 2 pts, 3 pts) - 9 viradas
Anegakoji - 3 cartas (2 pts, 2 pts, 2 pts) - 7 viradas

Todos os clãs usam nomes e brasões de família japoneses reais e foram projetados para combinar com o estilo original.